Giấy phép môi trường có nhiều loại mẫu khác nhau để phân biệt được thì chúng ta sẽ căn cứ vào loại tài nguyên và lĩnh vực hoạt động để có thể phân biệt được đó là loại nào.
Căn cứ vào loại tài nguyên
Đối với tài nguyên nước, giấy phép tài nguyên nước bao gồm: Giấy phép thăm dò nước dưới đất; giấy phép khai thác, sử dụng nước mặt; giấy phép khai thác, sử dụng nước dưới đất; giấy phép khai thác, sử dụng nước biển; giấy phép xả nước thải vào nguồn nước (Luật tài nguyên nước 2012)
Đối với thủy sản có thể kể đến giấy phép khai thác thủy sản trên biển, giấy phép đối với tổ chức, cá nhân nước ngoài có tàu hoạt động thủy sản trong vùng biển Việt Nam (Luật thủy sản 2017)
Đối với khoáng sản: Giấy phép thăm dò khoáng sản, giấy phép khai thác khoáng sản, giấy phép khai thác tận thu khoáng sản (Luật khoáng sản 2010)
Căn cứ theo lĩnh vực hoạt động:
Trong lĩnh vực giao thông vận tải: Giấy phép vận chuyển
Trong lĩnh vực xử lý chất thải: Giấy phép xử lý chất thải nguy hại
Trong lĩnh vực xây dựng: Giấy phép xây dựng.
Tùy thuộc vào lĩnh vực hoạt động, đối tượng tác động của dự án, chủ doanh nghiệp, chủ đầu tư dự án phải xin giấy phép bảo vệ môi trường khác nhau.
Theo đó, thủ tục làm giấy phép môi trường cũng khác nhau.
Và hồ sơ xin cấp giấy phép môi trường cần phải có đầy đủ các loại giấy tờ sau: Đơn xin cấp giấy phép về môi trường, Bản kê khai hiện trạng về môi trường, Quyết định phê chuẩn báo cáo đánh giá tác động môi trường (đối với các cơ sở phải thẩm định báo cáo đánh giá tác động môi trường) hoặc ý kiến bằng văn bản của cơ quan quản lý Nhà nước về bảo vệ môi trường (đối với cơ sở phải lập bản kê khai các hoạt động sản xuất có ảnh hưởng đến môi trường), Giấy xác nhận kiểm soát ô nhiễm của cơ quan quản lý Nhà nước về bảo vệ môi trường cấp cho cơ sở.